Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-24P63145 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms