Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIK1P57059 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SIK1P57059 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIK1P57059 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIK1P57059 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIK1P57059 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIK1P57059 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIK1P57059 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SIK1P57059 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SIK1P57059 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIK1P57059 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIK1P57059 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIK1P57059 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIK1P57059 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIK1P57059 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIK1P57059 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIK1P57059 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIK1P57059 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIK1P57059 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIK1P57059 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIK1P57059 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SIK1P57059 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms