Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GEMP55040 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GEMP55040 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GEMP55040 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GEMP55040 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GEMP55040 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GEMP55040 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GEMP55040 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GEMP55040 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GEMP55040 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GEMP55040 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GEMP55040 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GEMP55040 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GEMP55040 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GEMP55040 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GEMP55040 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GEMP55040 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GEMP55040 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms