Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNQ1P51787 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms