Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms