Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DAP3P51398 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DAP3P51398 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DAP3P51398 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DAP3P51398 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DAP3P51398 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
DAP3P51398 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DAP3P51398 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
DAP3P51398 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
DAP3P51398 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
DAP3P51398 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms