Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CDKN1BP46527 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms