Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RECQLP46063 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RECQLP46063 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RECQLP46063 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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