Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFSF9P41273 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFSF9P41273 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms