Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GTF2H1P32780 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms