Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMB4P28070 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMB4P28070 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms