Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PLNP26678 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms