Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DPA1P20036 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms