Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRAFP15056 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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