Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCAP01258 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCAP01258 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CALCAP01258 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCAP01258 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCAP01258 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCAP01258 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCAP01258 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCAP01258 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCAP01258 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCAP01258 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCAP01258 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CALCAP01258 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms