Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LDLRP01130 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LDLRP01130 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LDLRP01130 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LDLRP01130 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LDLRP01130 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LDLRP01130 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LDLRP01130 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LDLRP01130 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LDLRP01130 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LDLRP01130 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LDLRP01130 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LDLRP01130 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LDLRP01130 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LDLRP01130 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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