Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CREB3O43889 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms