Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 AL122035.2-201ENST00000609125 1870 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 AC092335.1-201ENST00000509037 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
A4D1N5 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
A4D1N5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms