Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TRAF6Q9Y4K3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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