Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms