Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TCAF1Q9Y4C2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TCAF1Q9Y4C2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TCAF1Q9Y4C2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TCAF1Q9Y4C2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TCAF1Q9Y4C2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TCAF1Q9Y4C2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TCAF1Q9Y4C2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TCAF1Q9Y4C2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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TCAF1Q9Y4C2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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TCAF1Q9Y4C2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TCAF1Q9Y4C2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TCAF1Q9Y4C2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TCAF1Q9Y4C2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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