Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD3Q9P035 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms