Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ROPN1BQ9BZX4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms