Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SLC13A1Q9BZW2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC13A1Q9BZW2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms