Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM83CQ9BQN1 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms