Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PITX2Q99697 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms