Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PHOX2BQ99453 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2BQ99453 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms