Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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ATG4AQ8WYN0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ATG4AQ8WYN0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ATG4AQ8WYN0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ATG4AQ8WYN0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ATG4AQ8WYN0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ATG4AQ8WYN0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG4AQ8WYN0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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