Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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COPS9Q8WXC6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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COPS9Q8WXC6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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COPS9Q8WXC6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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COPS9Q8WXC6 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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COPS9Q8WXC6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 KIAA0556-201ENST00000261588 6616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
COPS9Q8WXC6 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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