Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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TTC29Q8NA56 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TTC29Q8NA56 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TTC29Q8NA56 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TTC29Q8NA56 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TTC29Q8NA56 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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