Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms