Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LAMA3Q16787 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LAMA3Q16787 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LAMA3Q16787 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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