Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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