Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SEC23BQ15437 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEC23BQ15437 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEC23BQ15437 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEC23BQ15437 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEC23BQ15437 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEC23BQ15437 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEC23BQ15437 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEC23BQ15437 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEC23BQ15437 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEC23BQ15437 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEC23BQ15437 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEC23BQ15437 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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