Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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CDK5R1Q15078 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5R1Q15078 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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