Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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