Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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PMS2P3Q13401 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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