Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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AP3B2Q13367 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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AP3B2Q13367 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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AP3B2Q13367 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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