Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRJQ12913 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRJQ12913 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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