Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPAQ06546 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms