Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APBA1Q02410 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms