Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HOXC5Q00444 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms