Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PITX1P78337 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PITX1P78337 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PITX1P78337 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms