Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SH3BP2P78314 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SH3BP2P78314 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SH3BP2P78314 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SH3BP2P78314 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SH3BP2P78314 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SH3BP2P78314 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2P78314 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SH3BP2P78314 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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SH3BP2P78314 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2P78314 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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