Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HBBP68871 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HBBP68871 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HBBP68871 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HBBP68871 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HBBP68871 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HBBP68871 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HBBP68871 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HBBP68871 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HBBP68871 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HBBP68871 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HBBP68871 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HBBP68871 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HBBP68871 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HBBP68871 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HBBP68871 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HBBP68871 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms