Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GNB1P62873 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GNB1P62873 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GNB1P62873 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GNB1P62873 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GNB1P62873 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GNB1P62873 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GNB1P62873 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GNB1P62873 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GNB1P62873 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GNB1P62873 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GNB1P62873 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GNB1P62873 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GNB1P62873 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GNB1P62873 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GNB1P62873 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
GNB1P62873 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
GNB1P62873 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
GNB1P62873 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms