Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ABCE1P61221 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ABCE1P61221 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms