Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EPHB1P54762 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms