Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NFKB1P19838 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NFKB1P19838 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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