Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TSPAN8P19075 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TSPAN8P19075 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms